Als bei Waldrodungsarbeiten auf der japanischen Insel Hokkaido das Siegel der Elias gefunden wird, droht der dreiköpfige Drache Desighidora aus seinem alten Felsgestein bestehenden Gefängnis auszubrechen. Die beiden Feen Moll und Lora ahnen das Unheil und eilen nach Japan, um dem Monster mithilfe des mystischen Nachtfalters Mothra den Garaus zu machen...