Das Eis der Polkappen ist in naher Zukunft durch den Treibhauseffekt geschmolzen und die Erde überflutet. Die letzten Menschen leben quer über den Planeten verstreut und ein verrückter Wissenschaftler will mit Hilfe von gezüchteten Mutanten die letzten Menschen vernichten. Die verbliebenen Staaten schicken nun einen Konvoi aus Kriegsschiffen gegen die Insel des Wissenschaftlers. Darunter befindet sich die Blue Six, ein hochmoderners U-Boot, das die Schlüsselrolle in diesem Konflikt spielt.