Aufgezogen und trainiert von Ninjutsu-Meister Splinter in der Kanalisation von New York City, wagen sich die Turtles - Leonardo, Raphael, Donatello und Michelangelo - erstmals an die Oberfläche, um eine wundersame, aber auch feindselige neue Welt zu erkunden. Dort müssen sie sich Gegnern stellen, die gefährlicher sind, als sie es sich je ausgemalt hätten. Nebenbei freunden sich die vier Brüder mit der resoluten Teenagerin April O'Neil an und machen sich neue Feinde in Gestalt von Shredder, seinem Foot Clan und den außerirdischen Kraang.
