In der Türkei wird auf dem Berg Ararat die berühmt Arche Noah gefunden. Grund genug für die Geheimorganisation ARCAM, ihren besten Agenten, den Spriggan Yu Ominae, auszu senden, um die Ausgrabungen zu überwachen. Doch bereits kurz nach seiner Ankunft in Istanbul wird ein Anschlag auf ihn verübt und eine spannende Jagd auf die Arche Noah beginnt.