Der Film enthüllt, wie sich die lebenslangen Freunde Scooby und Shaggy kennengelernt und mit den jungen Detektiven Fred, Velma und Daphne zusammengetan haben, um die berühmte Agentur Mystery Inc. zu gründen. Jetzt, nach Hunderten gelöster Fälle und gemeinsamer Abenteuer, stehen Scooby und seine Gang vor ihrem größten, schwierigsten Rätsel überhaupt: einer Verschwörung, um den Geisterhund Cerberus auf die Welt loszulassen. Während sie diese globale "Hundepokalypse" aufzuhalten versuchen, finden sie heraus, dass Scooby ein geheimes Vermächtnis und ein episches Schicksal hat, größer, als sie je gedacht hätten.
