Auch weit in der Zukunft, im Jahr 2050, ist Kong immer noch die stärkste Kreatur, die je geboren wurde, und seine vielen menschlichen Charakterzüge machen ihn zum ultimativen Helden. Die Gefängnisinsel Alcatraz hat sich zum eindrucksvollsten Naturschutzgebiet des Planeten verwandelt, doch als die Hauptattraktion plötzlich überschnappt und Kong zum Staatsfeind Nr. 1 wird, hat der Schurke, der ihm das eingebrockt hat, freie Bahn, um eine Armee gigantischer Roboter-Dinosaurier auf die ahnungslose Welt loszulassen. Nur Kong kann diese übermächtigen Dinos und das böse Genie, von dem sie gesteuert werden, stoppen. Zwar ist er nun der meistgejagte Flüchtling der Welt, aber zum Glück gibt es drei junge Menschen, die die Wahrheit kennen und bereit sind, ihr Leben zu riskieren, um Kong zu helfen, der Gefangenschaft zu entgehen, während er für die Rettung der Menschheit kämpft.