FBI-Agentin Audrey Parker (Emily Rose), eine Waise aus Ohio, verschlägt es in die fiktive Kleinstadt Haven, Maine, wo sie dem Tod eines entflohenen Sträflings auf den Grund gehen will - normalerweise ein Routine-Job, doch in Haven ist nicht alles, wie es scheint. Als die Einwohner schon zum zweiten Mal in der Geschichte der Stadt von übernatürlichen Krankheiten befallen werden, die die Ärzte vor ein Rätsel stellen, erkennt Audrey allmählich, dass ihre Ankunft in Haven vielleicht doch kein reiner Zufall war und sie selbst nicht die ist, die sie bisher zu sein glaubte. Zusammen mit Nathan Wuornos (Lucas Bryant), dem Sohn des örtlichen Polizeichefs, macht sie sich daran, die mysteriöse Plage zu untersuchen und einen Weg zu finden, ihr Einhalt zu gebieten. Dabei kommt sie auch ihrer eigenen Vergangenheit und wahren Identität auf die Spur. Die Serie ist von Stephen Kings Roman "The Colorado Kid" inspiriert.