Das "American Policy Institute", eine Denkfabrik mit Sitz in New York, sammelt in Abstimmung mit den Top-Sicherheitsinstitutionen des Landes Geheimdienstinformationen von überall auf der Welt. Expertenteams bauen das Wissen über bekannte Terroristen und terroristische Verschwörungen kontinuierlich aus, um es anderen Einrichtungen zu ermöglichen, sie aufzuhalten. Will Travers (James Badge Dale), ein brillanter Analytiker, ist neu an Bord und übernimmt gleich ein eigenes Team. Obwohl er noch immer unter dem Verlust von Frau und Tochter leidet, die Opfer der Terroranschläge am 11. September 2001 wurden, gelingt es ihm, in den Kreuzworträtseln verschiedener Zeitungen, die alle am selben Tag erschienen sind, ein rätselhaftes Muster zu entdecken. Nachdem er seinem Mentor, Schwiegervater und Vorgesetzten David Haras (Peter Gerety), davon erzählt und der den Fund selbst an die API-Führungsspitze weitergegeben hat, stirbt Haras bei einem mysteriösen Zugunglück. Will, der seine Nachfolge antritt, glaubt nicht an einen Unfall und kommt allmählich einer Veschwörung von nationaler Tragweite auf die Spur.