Die actiongeladene, für ihre spektakulären Stunts bekannte Serie dreht sich um die riskanten Einsätze der "Kripo Autobahn", einer fiktiven Abteilung der deutschen Autobahnpolizei. Die beiden Kriminalhauptkommissare Semir Gerkhan (Erdogan Atalay) und Ben Jäger (Tom Beck) bilden das "Cobra 11"-Team, das die Aufgabe hat, Verbrechen verschiedenster Art aufzuklären und die Täter dingfest zu machen. Dabei sind halsbrecherische Verfolgungsjagden, krachende Explosionen, wilde Schusswechsel und schlagkräftige Prügeleien an der Tagesordnung.
Semirs Partner wechselte mehrfach im Serienverlauf, ein neuer neunter Partner wird mit Staffel 46 eingeführt.