Die ehrgeizigen Teenager-Superhelden Robin, Aqualad, Kid Flash und Speedy wollen endlich aus dem Schatten ihrer berühmten Mentoren, den Justice-League-Mitgliedern Batman, Aquaman, Flash und Green Arrow, treten und sich selbst einen Namen machen. Während Speedy kurzerhand seine Partnerschaft mit Green Arrow aufkündigt und sich in Red Arrow umbenennt, versuchen die anderen drei ihren Wert zu beweisen, indem sie heimlich eine Mission der Justice League übernehmen. Dabei machen sie nicht nur eine schockierende Entdeckung, sondern stoßen auch noch auf Superboy, einen jugendlichen Superman-Klon. Letztlich erlaubt Batman ihnen tatsächlich, ein verdeckt operierendes Spezialteam zu bilden, das all jene Aufträge erledigt, für die die Justice League zu bekannt ist. Anders als der Titel vermuten lässt, basiert die Serie nicht auf den Young Justice-Comics, sondern auf dem DC-Universum als solchem, wobei der Fokus auf den jungen Helden liegt. Die zweite Staffel trägt den Titel Young Justice - Invasion. Die dritte Staffel nennt sich Young Justice - Outsiders, die vierte Young Justice - Phantoms.