Zack Snyder gab bekannt, dass die finale Laufzeit von Watchmen noch nicht fest steht, der Film aber immer kürzer wird. Die aktuelle Version beträgt 2 Stunden und 35 Minuten. Im Vergleich zu Snyders 300 eine respektable Laufzeit, war der Film doch mit 1 Stunde und 58 Minuten wesentlich kürzer, aber auch kinofreundlicher. Daher wird die ein oder andere Szene von Watchmen sicherlich noch ausgemustert.
Verglichen mit dem aktuellen Director's Cut ist die derzeitige Version von Watchmen aber schon recht kurz. Der DC hat schon jetzt eine Laufzeit von 3 Stunden und 10 Minuten. Doch wer jetzt befürchtet, nie den "richtigen" Film sehen zu können, für den hat Snyder eine Überraschung parat.
Parallel zum Kinostart im März soll der animierte Film Tales of the Black Freighter auf DVD erscheinen. Hierbei handelt es sich um einen Comic im Comic und erzählt wird die Geschichte von einem jungen Seemann, dessen Schiff von Piraten (The Black Freighter) versenkt wird. Gestrandet fasst der Seemann einen grausamen Plan und baut sich ein Schiff aus seinen toten Kameraden. Sein Ziel ist es, seinen Heimathafen vor den Piraten zu erreichen. Die Geschichte wird parallel zu den Watchmen-Comics erzählt und hat viele Überschneidungen.
Neben der Kinofassung von Watchmen arbeitet Zack Snyder daher noch an einer The Black Freighter"-Version des Films. Diese wird beide Filme verbinden und soll eine Laufzeit von knapp 3 Stunden und 40 Minuten haben. Es versteht sich von selbst, dass diese Version nur etwas für echte Hardcore-Fans ist. Snyder bezeichnet die Version als die große epische Variante von Watchmen. Erscheinen soll diese irgendwann nach der Kinoveröffentlichung.